اشباع نقشه پیوستگی ریزماهواره ای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی fukuho-komugi × oligo-culm با استفاده از نشانگرهای aflp

نویسندگان

مهدی رحیم ملک

m. rahimmalek بدر الدین ابراهیم سید طباطبایی

b.e. sayed tabatabaei سید ابوالقاسم محمدی

s.a. mohammadi

چکیده

نقشه های ژنتیکی با پوشش بالای ژنوم نقش بسزایی در تحقیقات پایه و کاربردی ژنتیک ایفا می کنند. در دهه های اخیر با پیدایش نشانگرهای dna تحول عظیمی در تهیه نقشه های ژنتیکی در گیاهان مختلف به خصوص گندم به وجود آمده است. در این تحقیق، از نشانگر aflpبرای اشباع نقشه ژنتیکی 107فرد هاپلوئید مضاعف حاصل از تلاقی دو والد به نام های fukuho-komugi × oligo-culm دریافت شده از مرکز تحقیقات بین المللی کشاورزی ژاپن استفاده گردید. از چهارچوب نقشه ژنتیکی این جمعیت به عنوان نقشه پایه در تجزیه و تحلیل های بعدی استفاده شد. تجزیهaflp با استفاده از آنزیم های برشی msei/psti انجام گرفت. متوسط درصد چند شکلی نشانگر  16/6% aflp بود. تجزیه داده ها توسط نرم افزار 3/3 mapmaker/exp ver با معیار حداکثر فاصله 50 سانتی مورگان و حداقل lod برابر 3 و رسم نقشه گروه های پیوستگی توسط نرم افزارdrawmap ver1.1 انجام گرفت. 115 نشانگر aflp به 10 گروه منتسب شدند و تعدادی نیز به صورت غیرپیوسته باقی ماندند. تجزیه تکمیلی داده ها به همراه نشانگرهای ریزماهواره، موقعیت کروموزومی نشانگرها را تعیین کرد. در نهایت 1/71% نشانگرها به ژنوم a ، 16/5% به ژنوم b و تنها 3% به ژنوم d تخصیص یافتند. نشانگرهای aflp مورد استفاده در این تحقیق توانستند در مجموع 11 فاصله خالیرا درهفت کروموزوم  (2a،3a،7a،2b،3b،5b،7b) پر نمایند. پوشش کم ژنوم d توسط نشانگرها به دلیل سطح کم چند شکلی در این ژنوم در جمعیت های مختلف و حالت حفظ شده آن در جمعیت های گوناگون می باشد. در بین کروموزوم ها، بیشترین تعداد نشانگر(60) به کروموزوم 7b تخصیص داده شد. توزیع نشانگرها روی این کروموزوم غیریک نواخت بود. توزیع غیریک نواخت نشانگر روی این کروموزوم به تجمع نشانگرهای aflp در نواحی هتروکروماتین به خصوص اطراف سانترومر مربوط می شود.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

اشباع نقشه پیوستگی ریزماهواره‌ای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی Fukuho-Komugi × Oligo-Culm با استفاده از نشانگرهای AFLP

Genetic maps with high genome coverage are becoming increasingly useful in both basic and applied genetic researches. In the last decades, the advent of DNA markers has brought about a magnificent revolution in the production of genetic map, especially in wheat. In the present study, AFLP markers were used to saturate linkage map of 107 doubled haploid individuals produced through Fukuho _Komug...

متن کامل

اشباع نقشه پیوستگی ریزماهواره‌ای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی Fukuho-Komugi × Oligo-Culm با استفاده از نشانگرهای AFLP

Genetic maps with high genome coverage are becoming increasingly useful in both basic and applied genetic researches. In the last decades, the advent of DNA markers has brought about a magnificent revolution in the production of genetic map, especially in wheat. In the present study, AFLP markers were used to saturate linkage map of 107 doubled haploid individuals produced through Fukuho _Komug...

متن کامل

اشباع نقشه ژنتیکی و مکان‌یابی ژن‌های کنترل کننده صفات با استفاده از خانواده‌های F3 حاصل از تلاقی بادیا×کویر

جو (L. vulgare Hordeum) یک گیاه مدل برای پژوهش‌های ژنتیکی و فیزیولوژیکی بوده و سازگاری بالایی بـه شـرایط مختلـف نـشان می‌دهد. به منظور مکان‌یابی QTLهای ژنومی‌ کنترل‌کننده صفات زراعی جو آزمایشی در سال زراعی 1396 - 1395 با 104 خانواده به همراه والدین آنها ( بادیا و کویر) در مزرعه تحقیقاتی دانشکده گنبدکاووس در قالب طرح اگمنت اجرا گردید. بیوماس، وزن سنبله‌، تعداد سنبله، طول سنبله‌، عملکرد دانه، طول...

متن کامل

اشباع نقشه ژنتیکی و مکان‌یابی ژن‌های کنترل کننده صفات با استفاده از خانواده‌های F3 حاصل از تلاقی بادیا×کویر

جو (L. vulgare Hordeum) یک گیاه مدل برای پژوهش‌های ژنتیکی و فیزیولوژیکی بوده و سازگاری بالایی بـه شـرایط مختلـف نـشان می‌دهد. به منظور مکان‌یابی QTLهای ژنومی‌ کنترل‌کننده صفات زراعی جو آزمایشی در سال زراعی 1396 - 1395 با 104 خانواده به همراه والدین آنها ( بادیا و کویر) در مزرعه تحقیقاتی دانشکده گنبدکاووس در قالب طرح اگمنت اجرا گردید. بیوماس، وزن سنبله‌، تعداد سنبله، طول سنبله‌، عملکرد دانه، طول...

متن کامل

بررسی نتایج حاصل از تلاقی دای‌آلل در گندم نان تحت شرایط تنش رطوبتی با استفاده از روش GGE-biplot

مقدمه از تلاقی‌های دای‌آلل جهت بررسی عمل ژن و تعیین گروه‌ها و الگوهای هتروتیک می‌توان استفاده نمود. دردهه‌ی اخیر استفاده از روش گرافیکی یا روش  GGE biplot  در بررسی اثر متقابل ژنوتیپ × محیط در برنامه‌های به‌نژادی متداول شده است. در این روش اثر ژنوتیپ و اثر متقابل ژنوتیپ و محیط از هم تفکیک‌شده و گزینش ارقام پایدار بر اساس هر دو اثر مذکور صورت می‌گیرد. زمانی که GGE biplot برای داده‌های دای‌آلل اس...

متن کامل

نقشه یابی QTLهای متحمل به شوری در نتاج حاصل از تلاقی ارقام گاسپارد و خارچیا در گندم نان

For QTL mapping of related salt tolerance QTLs and determining the contribution of each QTL to phenotypic variation, a population consisting of 96 F2:3 families derived from the cross Kharchia (parent tolerant) and Gaspard (susceptible parent) were evaluated during 2 years. Of the 92 microsatellite markers used to evaluate parents, 32 markers were polymorphic which were used for analysis. Three...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
تولید محصولات زراعی و باغی

جلد ۱۲، شماره ۴۳، صفحات ۵۶۵-۵۷۵

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023